RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 PLCE1Q9P212 2302 aa8.84□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.84□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SOSTQ9BQB4 213 aa8.84□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.84□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 Q6ZS52 159 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 LHX8Q68G74 356 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 GPHA2Q96T91 129 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TNXAQ16473 311 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 ARF6P62330 175 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SFRP2Q96HF1 295 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SYNGR1O43759 233 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 HLA-DRB1P01911 266 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SCTP09683 121 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 RELBQ01201 579 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 M0R296 226 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 STAG3L3P0CL85 134 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 APELAP0DMC3 54 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SHISA3A0PJX4 238 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 A6NNC1 897 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 GOSR1O95249 250 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 HPRT1P00492 218 aa8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 GPR35Q9HC97 309 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 DPRXA6NFQ7 191 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 IL11P20809 199 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 CBLN1P23435 193 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TWIST1Q15672 202 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TNFSF10P50591 281 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 HYAL1Q12794 435 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 WDR90Q96KV7 1748 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 MT-CO3P00414 261 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 ZNF716A6NP11 495 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 A8MWL6 223 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TMPRSS2O15393 492 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TNFSF15O95150 251 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SPINK14Q6IE38 97 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 A0A1B0GWB2 263 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 HBZP02008 142 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 R4GN57 208 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 J3QT63 122 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 COL9A1P20849 921 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 ZPBPQ9BS86 351 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 J3QR06 171 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 COX7A1P24310 79 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 OR5R1Q8NH85 324 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 NPIPB7O75200 414 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 FBLN7Q53RD9 439 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 CCL17Q92583 94 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 GLRX5Q86SX6 157 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 ZNF721Q8TF20 911 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 THYN1Q9P016 225 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 HCFC1P51610 2035 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 MPDU1O75352 247 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 HARBI1Q96MB7 349 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 FXYD3Q14802 87 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 CA11O75493 328 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 NUDT3O95989 172 aa8.81□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 ADIPOQQ15848 244 aa8.81□□□□□ -1
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