RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 RHBDL1O75783 438 aa6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 RPEL1Q2QD12 228 aa6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 SLC25A28Q96A46 364 aa6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 MMP9P14780 707 aa6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 SELENOTP62341 195 aa6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 MARC2Q969Z3 335 aa6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 C12orf57Q99622 126 aa6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 ACACAQ13085 2346 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 RAB32Q13637 225 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 Q5PR19 223 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 TEPPQ6URK8 271 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PP11 408 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 SIGLEC5O15389 551 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 WNT5AP41221 380 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 IL22RA2Q969J5 263 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 NABP1Q96AH0 204 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 SULT1A1P50225 295 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 UCP3P55916 312 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 TPPP2P59282 170 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 FAM201AQ5SY85 155 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 OR4X1Q8NH49 305 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 KPTNQ9Y664 436 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 PCNTO95613 3336 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 OOSP1A8MZH6 123 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 COMMD1Q8N668 190 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 TMEM140Q9NV12 185 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 DOK5Q9P104 306 aa6.74□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 TMEM178BH3BS89 294 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 CHEK1O14757 476 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 PAX6P26367 422 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 SSTR5P35346 364 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 S100A12P80511 92 aa6.73□□□□□ -1.33
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NANOG-201ENST00000229307 A0A1B0GTI1 187 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 DPRXA6NFQ7 191 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 IGKV1D-33P01593 117 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 IGKV1-33P01594 117 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 SRD5A1P18405 259 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 TOR2AQ5JU69 321 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.73□□□□□ -1.33
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NANOG-201ENST00000229307 NPAS1Q99742 590 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 M0R1W7 72 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 HYPMO75409 117 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 KBTBD11O94819 623 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 MPC2O95563 127 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 KHDC3LQ587J8 217 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 C12orf77C9JDV5 145 aa6.73□□□□□ -1.33
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NANOG-201ENST00000229307 IGKV3-15P01624 115 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 TRGV3P03979 118 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 CD37P11049 281 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 ZNF250P15622 560 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 HLA-GP17693 338 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 ZNF146Q15072 292 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 ZFP82Q8N141 532 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 PEMTQ9UBM1 199 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.73□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 A0A0G2JK05 382 aa6.72□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
NANOG-201ENST00000229307 HPXP02790 462 aa6.72□□□□□ -1.33
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