RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 GFRALQ6UXV0 394 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 REG4Q9BYZ8 158 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 WNT5AP41221 380 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 LEMD1Q68G75 181 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 OR8A1Q8NGG7 326 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 MYOFQ9NZM1 2061 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 TMPRSS2O15393 492 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 MMD2Q8IY49 270 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 GBGT1Q8N5D6 347 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 C19orf24Q9BVV8 132 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 GAGE10A6NGK3 116 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 KCNMB1Q16558 191 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SLC25A28Q96A46 364 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF137PP52743 207 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 GCSAMQ8N6F7 178 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM54Q969K7 222 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 GPHA2Q96T91 129 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 HYPMO75409 117 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 LEPROTL1O95214 131 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 PCP4P48539 62 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 Q8WTZ3 238 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SDF2L1Q9HCN8 221 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 BRWD3Q6RI45 1802 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ARL14EPLP0DKL9 152 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 C3AR1Q16581 482 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 CLDND2Q8NHS1 167 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 H0YIZ8 118 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 GNG7O60262 68 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZG16O60844 167 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ASCL3Q9NQ33 180 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 CTSBP07858 339 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SRIP30626 198 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 GFI1Q99684 422 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ONECUT1Q9UBC0 465 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 CA2P00918 260 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SSX8Q7RTT4 187 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 WNT5BQ9H1J7 359 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SOD3P08294 240 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 MARCH11A6NNE9 402 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 FOXL2P58012 376 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 HERVK_113P61574 105 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 LINC00869P0C866 280 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 OR10S1Q8NGN2 331 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SCN2AQ99250 2005 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 C8orf88P0DMB2 117 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 BMI1P35226 326 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 HERPUD1Q15011 391 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 CLEC1BQ9P126 229 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 CEACAM18A8MTB9 384 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 CD5P06127 495 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 MPV17P39210 176 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 NPBWR2P48146 333 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 RPL30P62888 115 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 OR5R1Q8NH85 324 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 GRAMD2BQ96HH9 432 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 UCP2P55851 309 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SOX8P57073 446 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SCGB1D4Q6XE38 83 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ASCL5Q7RTU5 278 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 HIGD1AQ9Y241 93 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 RTTNQ86VV8 2226 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 COX7A1P24310 79 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 GRIFINA4D1Z8 144 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 RAMP1O60894 148 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 DRAM1Q8N682 238 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 C5orf52A6NGY3 159 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 K7N7A8 449 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 GNB2P62879 340 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 COLCA2A8K830 154 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 M0QZ24 198 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 ORM1P02763 201 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 CLDN18P56856 261 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 PATE3B3GLJ2 98 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 MYOZ3Q8TDC0 251 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 UFC1Q9Y3C8 167 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA13-201ENST00000222753 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms