RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13547A2ARC0 163 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klri1B2KG20 248 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc20bD3Z3I0 519 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01806 116 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pet117P0DJF2 80 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab19P35294 217 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab5bP61021 215 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spock1Q62288 442 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r35Q8R2E2 296 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1324Q8VEU7 332 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eaf1Q9D4C5 268 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TslpQ9JIE6 140 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gnpnat1Q9JK38 184 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1490A0A1L1SVH0 321 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r91E9PZR7 307 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Colca2F8VPY8 239 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxb2P0C1T1 354 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ca6P18761 317 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ErhP84089 104 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rspo4Q8BJ73 228 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8C4X7 151 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mib2Q8R516 973 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ripply3Q924S9 152 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D9C7 252 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtco2P00405 227 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp2P08043 459 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TgfaP48030 159 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lhx4P53776 390 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CycsP62897 105 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prrx1P63013 245 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plppr1Q8BFZ2 325 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pqlc2Q8C4N4 293 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1462Q8VFW3 307 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1298Q8VGE6 312 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galnt11Q921L8 608 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NcmapQ99JS0 100 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B3GNT2Q9Z222 397 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc18b1D3Z5L6 459 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm19345G3UYD9 124 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Onecut1O08755 465 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnj3P63250 501 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr305Q7TS02 319 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr167Q8VGJ5 312 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpp14Q9CQH8 122 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpusd4Q9CWX4 377 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl9Q9EPL4 318 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sectm1bQ9JL59 212 aa11.2□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhox7aA2A4F1 281 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CymB7ZWD6 379 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rdh16O54909 317 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P18529 117 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dus4lQ32M08 324 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usf2Q64705 346 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IslrQ6GU68 428 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 F12Q80YC5 597 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MrgprfQ8VCJ6 343 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xcr1Q9R0M1 322 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Med13Q5SWW4 2171 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1223A0A1L1SU13 311 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr243E9PV96 316 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr628K7N6B2 316 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Srsf6Q3TWW8 339 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ArsgQ3TYD4 525 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcrip1Q3UGS4 97 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vma21Q78T54 101 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1283Q7TQY4 305 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BN57 294 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp119bQ8K0G9 543 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr186Q8VEX5 309 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr57Q8VGU7 319 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rgs19Q9CX84 216 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp944E9PUS4 492 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm15130F6PYN5 206 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nme1P15532 152 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oprk1P33534 380 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Parp16Q7TMM8 322 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Neil3Q8K203 606 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1155Q8VFR3 314 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H1fooQ8VIK3 304 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ergic1Q9DC16 290 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccl8Q9Z121 97 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SnapinQ9Z266 136 aa11.19□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5286E0CXI6 357 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TfpiO54819 306 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr113Q8VEU4 312 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr156Q8VGA9 318 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec6aQ9JKF4 209 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ackr1Q9QUI6 334 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav6n-7A0A075B6A6 116 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf122Q8BP31 155 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr84Q8CIM5 396 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TifabQ8JZM6 147 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem144Q8VEH0 348 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp407G3UVV3 2246 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr418A0A140T8J6 310 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhox3gB9EJQ9 160 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr746E9Q840 314 aa11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hist1h1bP43276 223 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccl7Q03366 97 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.7 ms