RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps19bp1Q8C6B9 143 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpn1Q8VCE2 372 aa10.93□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1002Q8VFK2 318 aa10.93□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo36Q9CQ24 188 aa10.93□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tomm40lQ9CZR3 308 aa10.93□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asb5Q9D1A4 329 aa10.93□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ramp3Q9WUP1 147 aa10.93□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr122W4VSP0 330 aa10.93□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv5-15A0A0A6YWC7 117 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc18b1D3Z5L6 459 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r173E9Q8V7 313 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SgcbP82349 320 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr125Q14AJ9 320 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A3galt2Q3V1N9 370 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1477Q7TQQ7 315 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atpaf1Q811I0 324 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r226Q8R2A8 298 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sf3b5Q923D4 86 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pip4p2Q9CZX7 257 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mdp1Q9D967 164 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekha3Q9ERS4 297 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab25Q9WTL2 213 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TinagQ9WUR0 475 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RbmxQ9WV02 391 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss1Q9Z1R9 246 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr548-ps1A0A1B0GSG0 314 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm39566A0A1B0GT45 1251 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex38A2A8T7 201 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933408B17RikG3X9B4 273 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmi1P25916 324 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UqcrhP99028 89 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zic4Q61467 341 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxb1Q64732 325 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp429Q7M6Y0 485 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr901Q7TRD1 311 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif5a2Q8BGY2 153 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930451G09RikQ8C5G4 195 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rdh9Q8K5C8 317 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700025F22RikQ9D9Y7 111 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr632Q9EPN9 317 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smco4Q9JIS3 59 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r4Q9JKT3 297 aa10.92□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn34dA2AGU5 210 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13769A2ATW2 309 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ElnP54320 860 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab5bP61021 215 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DhhQ61488 396 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Orm3Q63805 206 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1385Q7TQT1 309 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam169bQ8CHT6 337 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr830Q8VFJ5 315 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nmnat3Q99JR6 245 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl18Q9CQL5 180 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp869Q9DC47 529 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv14-126A0A075B5K0 117 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1150-ps1A0A1L1STL1 316 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Awat1A2ADU9 328 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifitm5O88728 134 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspb1P14602 209 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lhfpl4Q5U4E0 247 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a26Q5U680 274 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GcdhQ60759 438 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxf1Q61080 378 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AdoQ6PDY2 256 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17324Q8C6J8 137 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SccpdhQ8R127 429 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pomt1Q8R2R1 746 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr361Q8VF16 322 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gins3Q9CY94 216 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfpl1Q9DB43 310 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GrinaQ9ESF4 345 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnpnat1Q9JK38 184 aa10.91□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp69A2A761 587 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r121K7N6J4 314 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbx15O70306 602 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppt1O88531 306 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc7a10P63115 530 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il18P70380 192 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asphd1Q2TA57 360 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc38a2Q8CFE6 504 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajb11Q99KV1 358 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctag2Q9D9S4 219 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv6-5A0A0A6YWS9 119 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr896-ps1A0A1L1SRZ8 308 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1335B2RVY8 335 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr243E9PV96 316 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8020F6WLE9 229 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H3BKT1 185 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab3dP35276 219 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efnb2P52800 336 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arf1P84078 181 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9930022D16RikQ8BG27 128 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Txnl1Q8CDN6 289 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3gnt8Q8R3I9 389 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myct1Q8R411 188 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf9Q8VI33 264 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ints12Q9D168 461 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dkkl1Q9QZL9 230 aa10.9□□□□□ -0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr789A0A1L1SV77 312 aa10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.5 ms