RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637243.1

CHRNA4-218, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 85 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-218ENST00000637243 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 HERPUD1Q15011 391 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 MPV17LQ2QL34 196 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 GPR157Q5UAW9 335 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 SLC35E4Q6ICL7 350 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 OSR2Q8N2R0 312 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 PIP4P2Q8N4L2 257 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 SLC25A40Q8TBP6 338 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 MOB3AQ96BX8 217 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 OR10C1Q96KK4 312 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 POM121L2Q96KW2 1035 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 SEC11CQ9BY50 192 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 OR2J1Q9GZK6 312 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 WNT5BQ9H1J7 359 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 ARV1Q9H2C2 271 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 SPACA1Q9HBV2 294 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 PARP11Q9NR21 331 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 GPR173Q9NS66 373 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 NSG2Q9Y328 171 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 STARD10Q9Y365 291 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.81□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM178BH3BS89 294 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 K7EPK0 472 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 ADAP1O75689 374 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 SCO1O75880 301 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 HTR3BO95264 441 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 DIRAS3O95661 229 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 APOC3P02656 99 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 DBHP09172 617 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 CTXN2P0C2S0 81 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 SEC11BP0C7V7 166 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF728P0DKX0 622 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 IGLL1P15814 213 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 CTRB1P17538 263 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 FUT3P21217 361 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 GLRA1P23415 457 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 GABRR1P24046 479 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 CFHR2P36980 270 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 MDH2P40926 338 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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CHRNA4-218ENST00000637243 P2RY1P47900 373 aa4.8□□□□□ -1.64
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CHRNA4-218ENST00000637243 RAB5CP51148 216 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 F2RL1P55085 397 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 RBM11P57052 281 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 MALLQ13021 153 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 PSG7Q13046 419 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB32Q13637 225 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 IL13RA2Q14627 380 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM187Q14656 261 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 KIR2DS1Q14954 304 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 HMGN3Q15651 99 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 C6orf201Q7Z4U5 140 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.8□□□□□ -1.64
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CHRNA4-218ENST00000637243 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.8□□□□□ -1.64
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CHRNA4-218ENST00000637243 OR8G5Q8NG78 346 aa4.8□□□□□ -1.64
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CHRNA4-218ENST00000637243 OR5D18Q8NGL1 313 aa4.8□□□□□ -1.64
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CHRNA4-218ENST00000637243 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 IL22RA2Q969J5 263 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 SPIN2AQ99865 258 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 RSRP1Q9BUV0 290 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 BCL2L14Q9BZR8 327 aa4.8□□□□□ -1.64
CHRNA4-218ENST00000637243 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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