RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ARID1B-222	ENST00000637003	SCOC	Q9UIL1	159 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ARID1B-222	ENST00000637003	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM25A	B3EWG3	89 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM25C	B3EWG5	89 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM25G	B3EWG6	89 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003		H0YJW9	148 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003		M0QZK8	103 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	FGF16	O43320	207 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	ACTB	P60709	375 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	MMD	Q15546	238 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CNIH2	Q6PI25	160 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	HOGA1	Q86XE5	327 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003		H7C2Y5	167 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	HLA-DQB1	P01920	261 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	APOA1	P02647	267 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	ARPC4	P59998	168 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	MZT2A	Q6P582	158 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF383	Q8NA42	475 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	AP3S1	Q92572	193 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	SNAPC3	Q92966	411 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003		H3BMQ9	156 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	DIRAS3	O95661	229 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CTXN2	P0C2S0	81 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	TMBIM6	P55061	237 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF329	Q86UD4	541 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	ISOC1	Q96CN7	298 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	GHITM	Q9H3K2	345 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	IFT46	Q9NQC8	304 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		12	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CTDSP2	O14595	271 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	FBXO24	O75426	580 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	PRSS3	P35030	304 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CMTM3	Q96MX0	182 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	NBR2	O15453	112 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	IGHG2	P01859	326 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	PMP2	P02689	132 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	AADAC	P22760	399 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	FCGR2C	P31995	323 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	SOX6	P35712	828 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CBX5	P45973	191 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	GPHA2	Q96T91	129 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1W2PRX2	142 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	RGS5	O15539	181 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	TUSC2	O75896	110 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	TSPAN15	O95858	294 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	APOA2	P02652	100 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	HLA-DMA	P28067	261 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	MC5R	P33032	325 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	RFX2	P48378	723 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	LAX1	Q8IWV1	398 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	BVES	Q8NE79	360 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-222	ENST00000637003	PSMB11	A5LHX3	300 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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