RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.33□□□□□ -0.11
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CLN3-241ENST00000635861 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
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CLN3-241ENST00000635861 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.28□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 NEURL2Q9BR09 285 aa14.28□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 CCDC32Q9BV29 185 aa14.28□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.28□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 A0A1W2PN81 502 aa14.27□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 LINC01619G3V211 115 aa14.27□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 C3orf84H3BNL1 204 aa14.27□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 ST8SIA5O15466 376 aa14.27□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 UPK1BO75841 260 aa14.27□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 UCHL1P09936 223 aa14.27□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 CT45A6P0DMU7 189 aa14.27□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 CT45A5P0DMU8 189 aa14.27□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 CT45A7P0DMV0 189 aa14.27□□□□□ -0.12
CLN3-241ENST00000635861 ZBTB25P24278 435 aa14.27□□□□□ -0.12
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