RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 KIR2DS4P43632 304 aa13.17□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 KIR2DS1Q14954 304 aa13.17□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 LINC01551Q86U37 167 aa13.17□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 DPRXA6NFQ7 191 aa13.17□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 HYPMO75409 117 aa13.17□□□□□ -0.3
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PDE4C-211ENST00000597360 DECR2Q9NUI1 292 aa13.17□□□□□ -0.3
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PDE4C-211ENST00000597360 TNFSF4P23510 183 aa13.16□□□□□ -0.3
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PDE4C-211ENST00000597360 BCL3P20749 454 aa13.16□□□□□ -0.3
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PDE4C-211ENST00000597360 CDKN1BP46527 198 aa13.15□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 FASLGP48023 281 aa13.15□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 FXYD3Q14802 87 aa13.15□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 HIPK2Q9H2X6 1198 aa13.15□□□□□ -0.3
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PDE4C-211ENST00000597360 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa13.15□□□□□ -0.3
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PDE4C-211ENST00000597360 CCL2P13500 99 aa13.15□□□□□ -0.3
PDE4C-211ENST00000597360 C1orf174Q8IYL3 243 aa13.15□□□□□ -0.3
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PDE4C-211ENST00000597360 CLDN23Q96B33 292 aa13.15□□□□□ -0.3
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PDE4C-211ENST00000597360 NUDT11Q96G61 164 aa13.15□□□□□ -0.3
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PDE4C-211ENST00000597360 AP1S3Q96PC3 154 aa13.14□□□□□ -0.31
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PDE4C-211ENST00000597360 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.14□□□□□ -0.31
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PDE4C-211ENST00000597360 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
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PDE4C-211ENST00000597360 IGLC2P0DOY2 106 aa13.13□□□□□ -0.31
PDE4C-211ENST00000597360 IGLC3P0DOY3 106 aa13.13□□□□□ -0.31
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PDE4C-211ENST00000597360 PLPPR2Q96GM1 343 aa13.12□□□□□ -0.31
PDE4C-211ENST00000597360 TMEM147Q9BVK8 224 aa13.12□□□□□ -0.31
PDE4C-211ENST00000597360 HINT2Q9BX68 163 aa13.12□□□□□ -0.31
PDE4C-211ENST00000597360 SLC45A2Q9UMX9 530 aa13.12□□□□□ -0.31
PDE4C-211ENST00000597360 VENTXO95231 258 aa13.12□□□□□ -0.31
PDE4C-211ENST00000597360 LTC4SQ16873 150 aa13.12□□□□□ -0.31
PDE4C-211ENST00000597360 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa13.12□□□□□ -0.31
PDE4C-211ENST00000597360 AGMATQ9BSE5 352 aa13.12□□□□□ -0.31
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