RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.16□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.16□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 OR56B4Q8NH76 319 aa14.16□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 NABP2Q9BQ15 211 aa14.16□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 OR2D2Q9H210 308 aa14.16□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.16□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 J3QRK9 145 aa14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 PPYP01298 95 aa14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 CD74P04233 296 aa14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 TBPP20226 339 aa14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 LY6EQ16553 131 aa14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 ACTBL2Q562R1 376 aa14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 PYDC2Q56P42 97 aa14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
ZNF548-204ENST00000594693 ATRQ13535 2644 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 GPR137BO60478 399 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 SLC22A5O76082 557 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 IGLV2-14P01704 120 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 CD3DP04234 171 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 TAS2R19P59542 299 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 LSAMPQ13449 338 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 FBLN7Q53RD9 439 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 C5orf30Q96GV9 206 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 SRRQ9GZT4 340 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 M0QYG6 137 aa14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 IGKV1D-33P01593 117 aa14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 IGKV1-33P01594 117 aa14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 CSF1P09603 554 aa14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 Q8N402 240 aa14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 MOB3AQ96BX8 217 aa14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 M0R1X1 148 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 CHST1O43916 411 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 LINC00205P59089 165 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 TSPAN5P62079 268 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF45Q02386 682 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 MSMO1Q15800 293 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM219Q86XT9 240 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 Q8N6K4 173 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF383Q8NA42 475 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 RAB18Q9NP72 206 aa14.12□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 H0YJW9 148 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 OR2F2O95006 317 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 RAB3DO95716 219 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 MOSP00540 346 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 MC5RP33032 325 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 MFSD4AQ8N468 514 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM63Q969Q1 353 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.11□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 OR5H14A6NHG9 310 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 IFNA6P05013 189 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 CRYBA1P05813 215 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF735P0CB33 412 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM11P17152 192 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 GNRHRP30968 328 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 FXYD4P59646 89 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 HERV-K104P61576 105 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 HES1Q14469 280 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 HNF4GQ14541 408 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.1□□□□□ -0.15
ZNF548-204ENST00000594693 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms