RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593223.1

SMAD4-216, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD4, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-216ENST00000593223 PITX2Q99697 317 aa3.56□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 RARRES2Q99969 163 aa3.56□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.56□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ABCG5Q9H222 651 aa3.56□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 LRTM1Q9HBL6 345 aa3.56□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ENY2Q9NPA8 101 aa3.56□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 LAMA4Q16363 1823 aa3.56□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 NOTCH1P46531 2555 aa3.56□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 NBASA2RRP1 2371 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TXNDC9O14530 226 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 OR2J2O76002 312 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 HPNP05981 417 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 OR5G3P0C626 314 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 SLC35G6P0C7Q6 338 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ZNF286BP0CG31 522 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 LAMP1P11279 417 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 CD79AP11912 226 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 GPX2P18283 190 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 PSMD8P48556 350 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 LYZP61626 148 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 RHOBP62745 196 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 NDPQ00604 133 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 PSG4Q00888 419 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 SLC10A7Q0GE19 358 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TGIF1Q15583 401 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 CDNFQ49AH0 187 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TMEM215Q68D42 235 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 KCTD16Q68DU8 428 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 FTMTQ8N4E7 242 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 OR52E2Q8NGJ4 325 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 CYGBQ8WWM9 190 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 BORCS7Q96B45 105 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 EBF4Q9BQW3 602 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 FBXL15Q9H469 300 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 WFDC1Q9HC57 220 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TAS2R5Q9NYW4 299 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 PYCARDQ9ULZ3 195 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 CELA1Q9UNI1 258 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 MED13Q9UHV7 2174 aa3.55□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 F5P12259 2224 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 OR4C46A6NHA9 309 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 F6UB75 175 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 SLC22A1O15245 554 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 RDH16O75452 317 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 PTHP01270 115 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 P01737 135 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 H2AFZP0C0S5 128 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 PGA5P0DJD9 388 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 HLA-EP13747 358 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ZBTB25P24278 435 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 ADORA2BP29275 332 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TSPOP30536 169 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TALDO1P37837 337 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 PPICP45877 212 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 OR1D4P47884 311 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 GNG2P59768 71 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 IHHQ14623 411 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 NSDHLQ15738 373 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 PAGE3Q5JUK9 113 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 OR10K2Q6IF99 312 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 C6orf120Q7Z4R8 191 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 OAFQ86UD1 273 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 CBR4Q8N4T8 237 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 TMEM86BQ8N661 226 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.54□□□□□ -1.84
SMAD4-216ENST00000593223 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms