RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RBBP9O75884 186 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 NAPSAO96009 420 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TRGV3P03979 118 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CELP19835 753 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PSG5Q15238 335 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF880Q6PDB4 577 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF562Q6V9R5 426 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SGPP2Q8IWX5 399 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 AGMATQ9BSE5 352 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TFAP2AP05549 437 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR2CP28335 458 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ST3GAL4Q11206 333 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 INSL4Q14641 139 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 IZUMO2Q6UXV1 221 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SETD6Q8TBK2 473 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 NICN1Q9BSH3 213 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK15Q9H427 330 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ARSBP15848 533 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CD40LGP29965 261 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA13P48723 471 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 VEGFCP49767 419 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF5Q99942 180 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM59Q9BXS4 323 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1A1Q9P1Q5 309 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PROP1O75360 226 aa19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-16P04430 117 aa19.6■□□□□ 0.73
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CAPNS1-211ENST00000590874 UBBP0CG47 229 aa19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 GRPEL2Q8TAA5 225 aa19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CYGBQ8WWM9 190 aa19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA25Q9BR10 227 aa19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 HYDINQ4G0P3 5121 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB10A6NFE3 127 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB1BP1O14713 200 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A1O15245 554 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00205P59089 165 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC119Q13432 240 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TM2D1Q9BX74 207 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CPEP16870 476 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ZP3P21754 424 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 HAGHQ16775 308 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 IL34Q6ZMJ4 242 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 MOB1BQ7L9L4 216 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRTM1Q86UE6 522 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF383Q8NA42 475 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 POC5Q8NA72 575 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 THRSPQ92748 146 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0A6YYD4 124 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD34BA5PLL1 514 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDEFO95238 335 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM6P40199 344 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP4P55087 323 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT4P56705 351 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 FXYD3Q14802 87 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf100Q5SVJ3 147 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SETD9Q8NE22 299 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL12BO14950 172 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS16P62249 146 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DRB3P79483 266 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 LAIR2Q6ISS4 152 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5T1Q8NG75 326 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 OR9G4Q8NGQ1 327 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 AK3Q9UIJ7 227 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM14DPA8MWL7 114 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BUA1 57 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A17O43808 307 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB25P24278 435 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 QRFPP83859 136 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFA5Q01523 94 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSM3Q53FZ2 586 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC23Q5W5X9 447 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 GLT8D1Q68CQ7 371 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNG3Q8TAE7 436 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 EDARADDQ8WWZ3 215 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM30Q9UKF2 790 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB26Q9ULW5 256 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SCTP09683 121 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNJ2BPP57105 145 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 AHSA2Q719I0 299 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PDPNQ86YL7 162 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PTX4Q96A99 478 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-211ENST00000590874 Q9H521 79 aa19.54■□□□□ 0.72
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