RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM140Q9NV12 185 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 PSMB11A5LHX3 300 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 FCN1O00602 326 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 MT-ND6P03923 174 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 F2RP25116 425 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 HHEXQ03014 270 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF90Q03938 601 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 ZIC1Q15915 447 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 OR4F5Q8NH21 305 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 NAA60Q9H7X0 242 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 PRR32B1ATL7 298 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 CD27P26842 260 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 GAGE5Q13069 117 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 GAGE6Q13070 117 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF44Q7L0R7 432 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 GATSQ8NAP1 163 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 BMFQ96LC9 184 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 ARID1AO14497 2285 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A087WV48 116 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1W2PR80 420 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 LHX2P50458 406 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 HARBI1Q96MB7 349 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 JPT1Q9UK76 154 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-218ENST00000590367 OBSL1O75147 1896 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 C2orf72A6NCS6 295 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 TNFSF12O43508 249 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM87AP0C7U9 286 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 PNMTP11086 282 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 CD38P28907 300 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 RUNX1Q01196 453 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 PMP22Q01453 160 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 FCRL6Q6DN72 434 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 SDF2Q99470 211 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 IGSF23A1L1A6 192 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 GPR75O95800 540 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 NUDT14O95848 222 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 MPIG6BO95866 241 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 SERPINE2P07093 398 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF728P0DKX0 622 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP1CAP62136 330 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 SERF2P84101 59 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 GABRA6Q16445 453 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 ACKR1Q16570 336 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 ATOH7Q8N100 152 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 LRTM2Q8N967 370 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 OR52E5Q8NH55 327 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 BLNKQ8WV28 456 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 RAB1CQ92928 201 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 CACNA1CQ13936 2221 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM231BA6NCW3 169 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 C9orf118A6NHY6 69 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 HLA-DQA2P01906 255 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 NTF3P20783 257 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 TESK1Q15569 626 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-218ENST00000590367 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms