RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.39□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MED12Q93074 2177 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GUV1 79 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ARGFXA6NJG6 315 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF212BA8MTL3 300 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HMSDA8MTL9 139 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINE3A8MV23 424 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 G3V3Q6 166 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 G3V4G9 280 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SOCS1O15524 211 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CA11O75493 328 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RP2O75695 350 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2A4O95047 310 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN1O95832 211 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTL6AO96019 429 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR9G9P0C7N8 305 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 COX5BP10606 129 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ANOS1P23352 680 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 AGTR1P30556 359 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LHX2P50458 406 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN18P56856 261 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R46P59540 309 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB14P61106 215 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PSG4Q00888 419 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DHRS2Q13268 280 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RSU1Q15404 277 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 GRK1Q15835 563 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf183Q5T699 404 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX261Q6UWH6 196 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LYG2Q86SG7 212 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM251Q8N6I4 163 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MDS2Q8NDY4 140 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM104Q8NE00 496 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SGK3Q96BR1 496 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SDSLQ96GA7 329 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2A7Q96R45 310 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PHB2Q99623 299 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PECRQ9BY49 303 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HES7Q9BYE0 225 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL9Q9H1A3 318 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 BANF2Q9H503 90 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 COMMD9Q9P000 198 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 THYN1Q9P016 225 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 VSIG4Q9Y279 399 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 U3KQ87 197 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GW55 424 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C9orf170A2RU37 121 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C5orf63A6NC05 138 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RFPL4AA6NLU0 287 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ARPC5O15511 151 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SIX6O95475 246 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NRASP01111 189 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CD8AP01732 235 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-9P01782 118 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHG3P01860 377 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PMP2P02689 132 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINA5P05154 406 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV2-30P06310 120 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.37□□□□□ -1.87
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