RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		V9GYQ6	96 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARPC2	O15144	300 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GYPB	P06028	91 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CALB2	P22676	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRDX6	P30041	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VHL	P40337	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MAGEA2	P43356	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RAB32	Q13637	225 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF146	Q15072	292 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NPB	Q8NG41	125 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	COQ2	Q96H96	371 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FCN1	O00602	326 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SH2D1B	O14796	132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	E2F6	O75461	281 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DHRS3	O75911	302 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NDUFA3	O95167	84 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2H2	O95918	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CSN2	P05814	226 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CLU	P10909	449 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q8IYB0	196 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NRAC	Q8N912	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AMELY	Q99218	206 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1B0GW64	132 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		H3BN98	237 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ENTPD6	O75354	484 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF254	O75437	659 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DCTN3	O75935	186 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SOX14	O95416	240 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CALCB	P10092	127 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRKACA	P17612	351 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RASSF2	P50749	326 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MICA	Q29983	383 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM42	Q69YG0	159 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	REEP1	Q9H902	201 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM206A	Q9NX38	181 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms