RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A087X0M5	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A0U1RQK1	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1B0GX30	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1W2PPH5	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LINC00473	A8K010	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CENPX	A8MT69	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	NPFF	O15130	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PEX14	O75381	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CD99	P14209	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TBP	P20226	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC6A1	P30531	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SAA4	P35542	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RAB13	P51153	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PIGP	P57054	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SSX2	Q16385	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RITA1	Q96K30	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PRRT1	Q99946	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1W2PPE2	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1W2PR64	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1W2PRV1	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	GPR31	O00270	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CD5L	O43866	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RAMP3	O60896	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RGS11	O94810	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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