RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-216	ENST00000588477	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF785	A8K8V0	405 aa		11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	PDCD6	O75340	191 aa		11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477		Q96MT0	163 aa		11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	PEMT	Q9UBM1	199 aa		11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.54	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477		A0A1W2PPK0	400 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	OR11H12	B2RN74	326 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	EI24	O14681	340 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	OR2A4	O95047	310 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	CPE	P16870	476 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	AADAC	P22760	399 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	PMS2P11	Q13670	270 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	BVES	Q8NE79	360 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	CXorf65	A6NEN9	183 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477		H3BNX3	289 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	OGG1	O15527	345 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	SPDEF	O95238	335 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	ETV1	P50549	477 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	LINC00205	P59089	165 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477		Q499Y3	187 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	LAX1	Q8IWV1	398 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	COA4	Q9NYJ1	87 aa		11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	PROP1	O75360	226 aa		11.51	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	LALBA	P00709	142 aa		11.51	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	LGALS7	P47929	136 aa		11.51	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		11.51	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		11.51	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.51	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	SNAPC3	Q92966	411 aa		11.51	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.51	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	TMEM68	Q96MH6	324 aa		11.51	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477		A0A0B4J203	849 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	AIRE	O43918	545 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	APELA	P0DMC3	54 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	CAPG	P40121	348 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	GUCA2B	Q16661	112 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	SVOP	Q8N4V2	548 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		11.5	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	NUPR2	A6NF83	97 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	CEACAM6	P40199	344 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	PDPN	Q86YL7	162 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	BMPR1B	O00238	502 aa		11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	APOA2	P02652	100 aa		11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	EDN2	P20800	178 aa		11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	APH1B	Q8WW43	257 aa		11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	PHB2	Q99623	299 aa		11.48	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		11.47	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477		A0A0J9YWU9	116 aa		11.47	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	DEDD	O75618	318 aa		11.47	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	NAPSA	O96009	420 aa		11.47	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	IGLV2-23	P01705	113 aa		11.47	□□□□□ -0.57
IFT20-216	ENST00000588477	CRYGB	P07316	175 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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