RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF4-216ENST00000586813 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAF4-216ENST00000586813 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF4-216ENST00000586813 A0A0A6YYD4 124 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SLC22A1O15245 554 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 HLA-DRB3P79483 266 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 LFNGQ8NES3 379 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 OR4C12Q96R67 309 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CLCC1Q96S66 551 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 RNF5Q99942 180 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 ZMAT4Q9H898 229 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 EBAG9O00559 213 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 BPNT1O95861 308 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CA2P00918 260 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB25P24278 435 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CD40LGP29965 261 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 PSG5Q15238 335 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 RHOVQ96L33 236 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 MND1Q9BWT6 205 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 AK3Q9UIJ7 227 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 HSPA12AO43301 675 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SPDEFO95238 335 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 IGKV1-16P04430 117 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 TFAP2AP05549 437 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CPEP16870 476 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SRMP19623 302 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CEACAM6P40199 344 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 TENM2Q9NT68 2774 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SOCS1O15524 211 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 PROP1O75360 226 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 TRGV3P03979 118 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CDK1P06493 297 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CD37P11049 281 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 LYL1P12980 280 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 RCN1Q15293 331 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 RNLSQ5VYX0 342 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF383Q8NA42 475 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 PTX4Q96A99 478 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 STUB1Q9UNE7 303 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SCTP09683 121 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 UCHL1P09936 223 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 PDPNQ86YL7 162 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CITED4Q96RK1 184 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 LYSTQ99698 3801 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 Q9N2K0 584 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 PALMDQ9NP74 551 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SLC25A17O43808 307 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 IGLV1-51P01701 117 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 LINC00205P59089 165 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 FXYD3Q14802 87 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 P2RY14Q15391 338 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 SPHARQ15513 63 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 Q8N1Y9 231 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 POC5Q8NA72 575 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF221Q9UK13 617 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 HSF4Q9ULV5 492 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAF4-216ENST00000586813 APOA2P02652 100 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 ARSBP15848 533 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 ZP3P21754 424 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 GFI1Q99684 422 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 H3BUA1 57 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 SLC17A2O00624 439 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAF4-216ENST00000586813 LDLRAD4O15165 306 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms