RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPL30P62888 115 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR157Q5UAW9 335 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A0G2JRQ6 117 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10A7Q8NGE5 316 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 AUP1Q9Y679 476 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARID1AO14497 2285 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGKV1-5P01602 117 aa23.47■■□□□ 1.35
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IFI27L2Q9H2X8 130 aa23.47■■□□□ 1.35
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LPAR6P43657 344 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR12P47775 334 aa23.46■■□□□ 1.35
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C11orf71Q6IPW1 123 aa23.45■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF439Q8NDP4 499 aa23.45■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPL31P62899 125 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 BAP18Q8IXM2 172 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD300LFQ8TDQ1 290 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A32Q9H2D1 315 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa23.44■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C19orf12Q9NSK7 152 aa23.43■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C17orf98A8MV24 154 aa23.42■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CT45A3Q8NHU0 189 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB1BQ9H0U4 201 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa23.42■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF273Q14593 569 aa23.4■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC31A2O15432 143 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 EPHA1P21709 976 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 UTF1Q5T230 341 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF714Q96N38 554 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV2-70P01814 119 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1-210ENST00000574322 NCR3LG1Q68D85 454 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1-210ENST00000574322 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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