RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 OR5I1Q13606 314 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 GUK1Q16774 197 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 Q8WTZ3 238 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 PLK3Q9H4B4 646 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 C3orf80F5H4A9 247 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 ERVK11-1P61568 191 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 TFF3Q07654 80 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 DHRS2Q13268 280 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 KCTD9Q7L273 389 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 SEC22AQ96IW7 307 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 VAX2Q9UIW0 290 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.9□□□□□ -0.02
GDE1-203ENST00000564172 A0A1B0GW64 132 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 PDCD6O75340 191 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 CXCL1P09341 107 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 PGA5P0DJD9 388 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 LYL1P12980 280 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 FUT3P21217 361 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 BRICD5Q6PL45 260 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 FRZBQ92765 325 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 AGPAT2O15120 278 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 DUSP1P28562 367 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 MZT1Q08AG7 82 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ADIPOQQ15848 244 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 Q8IYB0 196 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 OR8U1Q8NH10 309 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 DCUN1D4Q92564 292 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 NUDT11Q96G61 164 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ROS1P08922 2347 aa14.89□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 OR8U9P0C7N5 309 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 MPV17LQ2QL34 196 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 AQP10Q96PS8 301 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 NMES1Q9C002 83 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 AK3Q9UIJ7 227 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 SHISA9B4DS77 424 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 M0QYG6 137 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ZG16O60844 167 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 TSPAN15O95858 294 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 OR4A8P0C604 315 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 DTYMKP23919 212 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 SPRY3O43610 288 aa14.87□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 PTTG1IPP53801 180 aa14.87□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 IL13RA2Q14627 380 aa14.87□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 WDR82Q6UXN9 313 aa14.87□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.87□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.87□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.87□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 TEX38Q6PEX7 206 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 Q6ZRG5 221 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 LINC00596Q86U02 117 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 HOGA1Q86XE5 327 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 POC1AQ8NBT0 407 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 MITD1Q8WV92 249 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 RAB39BQ96DA2 213 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 RNF126Q9BV68 326 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 CYB5BO43169 146 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 CD3EP07766 207 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 DYRK2Q92630 601 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 OR2V2Q96R30 315 aa14.86□□□□□ -0.03
GDE1-203ENST00000564172 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms