RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF714Q96N38 554 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 C17orf98A8MV24 154 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 K7EPK0 472 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAMP3O60896 148 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 PROP1O75360 226 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEDDO75618 318 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RLN2P04090 185 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNG10P50151 68 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMCO1Q147U7 214 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR146Q96CH1 333 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPIN2AQ99865 258 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 MSGN1A6NI15 193 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00473A8K010 186 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF345Q14585 488 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 MIOXQ9UGB7 285 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 M0R1X1 148 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFS7O75251 213 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV1-5P01602 117 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB7AP51149 207 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITGB1BP1O14713 200 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR37O15354 613 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 NXPH3O95157 252 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 COX6B1P14854 86 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKR1C2P52895 323 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ESCO2Q56NI9 601 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST8SIA3O43173 380 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 LYG1Q8N1E2 194 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCL2L11O43521 198 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 S1PR2O95136 353 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZRM9 215 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR8B2Q96RD0 313 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHD6Q8TD26 2715 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 A1L4Q6 167 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCL19Q99731 98 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZFP57Q9NU63 452 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 CACNG5Q9UF02 275 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GU03 582 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPDEFO95238 335 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRASP01116 189 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFNA7P01567 189 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 HKR1P10072 659 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLA2G2AP14555 144 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 G6PCP35575 357 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 HTR2BP41595 481 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 DLX6P56179 175 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC51BQ86UW2 128 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms