RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557356.5

PSEN1-222, Transcript of presenilin 1, human

TSL 4

Gene PSEN1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM235	A6NFC5	223 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	NBR2	O15453	112 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	TPPP	O94811	219 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	OR8U9	P0C7N5	309 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	CT45A6	P0DMU7	189 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	CT45A5	P0DMU8	189 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	CT45A7	P0DMV0	189 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	VDAC1	P21796	283 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	OR3A3	P47888	321 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	THBS3	P49746	956 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ARPC4	P59998	168 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP10-3	P60369	221 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	CD83	Q01151	205 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	PLGLA	Q15195	96 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	RTL8B	Q17RB0	113 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	TEX38	Q6PEX7	206 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356		Q6ZS46	218 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	PDPN	Q86YL7	162 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	BEST4	Q8NFU0	473 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	OR8U1	Q8NH10	309 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	RNF150	Q9ULK6	438 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356		H0YJW9	148 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356		M0R1X1	148 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	RRH	O14718	337 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	GABARAP	O95166	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	NDUFA3	O95167	84 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	SPDEF	O95238	335 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	HLA-DRB1	P01911	266 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	APOA1	P02647	267 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	IGF1	P05019	195 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ELANE	P08246	267 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	CD40LG	P29965	261 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	PRSS3	P35030	304 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	VBP1	P61758	197 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	MSMO1	Q15800	293 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	GPR107	Q5VW38	600 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356		Q6ZPA2	131 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	HOGA1	Q86XE5	327 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	STPG2	Q8N412	459 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	OR2D2	Q9H210	308 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	IFT46	Q9NQC8	304 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	STAB1	Q9NY15	2570 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSEN1-222	ENST00000557356	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	HLA-DQB1	P01920	261 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	SMIM18	P0DKX4	95 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	PF4V1	P10720	104 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	CD28	P10747	220 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	ALDH3B2	P48448	385 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	TMBIM6	P55061	237 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	F2RL1	P55085	397 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	TAS2R46	P59540	309 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	NCS1	P62166	190 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	FOXE3	Q13461	319 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM65	Q6PI78	240 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42

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