RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552931.1

SMARCC2-215, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 2, human

TSL 3

Gene SMARCC2, Length 608 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCC2-215	ENST00000552931	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SSX1	Q16384	188 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931		Q6ZS49	121 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	GALM	Q96C23	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	S1PR3	Q99500	378 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	RAB29	O14966	203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	RAMP3	O60896	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	MAS1	P04201	325 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	CD24	P25063	80 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	HTR2C	P28335	458 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	HSPA13	P48723	471 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	F2RL1	P55085	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	TMEM50B	P56557	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	UNC119	Q13432	240 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	P2RY14	Q15391	338 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SVOP	Q8N4V2	548 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931		A0A0B4J203	849 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	HSPB6	O14558	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SPDEF	O95238	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SOX6	P35712	828 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SERPINB10	P48595	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	UFD1	Q92890	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	GFI1	Q99684	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931		A0A0A6YYD4	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMARCC2-215	ENST00000552931	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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