RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	HOGA1	Q86XE5	327 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222		Q8N2B8	174 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ABHD1	Q96SE0	405 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PPE3	182 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SLC31A2	O15432	143 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	RGS11	O94810	467 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LPL	P06858	475 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MADCAM1	Q13477	382 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	BEST4	Q8NFU0	473 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	PRR25	Q96S07	402 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SOST	Q9BQB4	213 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	LEUTX	A8MZ59	168 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	SULT1C2	O00338	296 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ITGB1BP1	O14713	200 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	BET1	O15155	118 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	HSPA12A	O43301	675 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	PEX14	O75381	377 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	CEACAM3	P40198	252 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	CEACAM6	P40199	344 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	SSX2	Q16385	188 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	IFT46	Q9NQC8	304 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	NAT1	P18440	290 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ZNF137P	P52743	207 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	AANAT	Q16613	207 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RDH8	Q9NYR8	311 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222		A6NDX4	124 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	FABP12	A6NFH5	140 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OOSP1	A8MZH6	123 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	FCER2	P06734	321 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	IL3RA	P26951	378 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	S100A5	P33763	92 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	IL18	Q14116	193 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	CCDC190	Q86UF4	302 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR52I2	Q8NH67	350 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	CTDSPL	O15194	276 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RCVRN	P35243	200 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RAB7A	P51149	207 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	DYNLT3	P51808	116 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ARPC4	P59998	168 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		10.92	□□□□□ -0.66

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