RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ANOS1P23352 680 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-209ENST00000550857 SRRQ9GZT4 340 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-209ENST00000550857 G6PCP35575 357 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 REG1BP48304 166 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 RPRMQ9NS64 109 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV1D-33P01593 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV1-33P01594 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 TDGF1P13385 188 aa6.82□□□□□ -1.32
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