RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-220ENST00000550700 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-220ENST00000550700 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CS-220ENST00000550700 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-220ENST00000550700 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CS-220ENST00000550700 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-220ENST00000550700 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 NPFFO15130 113 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PEX14O75381 377 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RPA2P15927 270 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 BRS3P32247 399 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PIGPP57054 158 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 DHODHQ02127 395 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OXA1LQ15070 435 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 AANATQ16613 207 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 DRAM1Q8N682 238 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 NUDT15Q9NV35 164 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 NUP50Q9UKX7 468 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RNF150Q9ULK6 438 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 LY6LH3BQJ8 138 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 HSD17B6O14756 317 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 MPPED1O15442 326 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 APOA2P02652 100 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 IL5P05113 134 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 F2RP25116 425 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RAB13P51153 203 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RTL8BQ17RB0 113 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 HCP5Q6MZN7 132 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 LEAP2Q969E1 77 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 GALNT14Q96FL9 552 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RNF5Q99942 180 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PPE3 182 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 H0Y980 276 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 M0R1X1 148 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 FSHBP01225 129 aa7.56□□□□□ -1.2
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CS-220ENST00000550700 FBP1P09467 338 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 AKR1C4P17516 323 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 DYNLT3P51808 116 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RAB25P57735 213 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 C4orf46Q504U0 113 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PDPNQ86YL7 162 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 COQ8AQ8NI60 647 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 NAA60Q9H7X0 242 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.56□□□□□ -1.2
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CS-220ENST00000550700 VSIG4Q9Y279 399 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 A0A0B4J2A0 478 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 VGLL3A8MV65 326 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SLC31A2O15432 143 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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