RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 EFEMP2O95967 443 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 VAMP3Q15836 100 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.28□□□□□ -1.24
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