RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CD300A	Q9UGN4	299 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NCKAP5	O14513	1909 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ROS1	P08922	2347 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ANK2	Q01484	3957 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM223	A0PJW6	202 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5H1	A6NKK0	313 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNK1	O00180	336 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	PLPP3	O14495	311 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TP53I11	O14683	189 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MYL12B	O14950	172 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC22	O60826	627 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SPAG7	O75391	227 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MT-ND4	P03905	459 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	KDELR1	P24390	212 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CD79B	P40259	229 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEA3	P43357	314 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEA6	P43360	314 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR12D2	P58182	307 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	STX4	Q12846	297 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC32	Q5I0X7	151 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308		Q5W150	140 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZT83	130 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SSX6	Q7RTT6	188 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MDP1	Q86V88	176 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RPRML	Q8N4K4	120 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MORN4	Q8NDC4	146 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1S1	Q8NH92	325 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NT5C	Q8TCD5	201 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	GTF2H4	Q92759	462 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	S100PBP	Q96BU1	408 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF157	Q96PX1	679 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		2.55	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NACA	E9PAV3	2078 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CHST10	O43529	356 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SGCE	O43556	437 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFS5	O43920	106 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MFSD11	O43934	449 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SCN2B	O60939	215 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV3-11	P01762	117 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	C1QA	P02745	245 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TTPA	P49638	278 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MNAT1	P51948	309 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	DSTN	P60981	165 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTG1	P63261	375 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SLAMF1	Q13291	335 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TPBG	Q13641	420 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CDNF	Q49AH0	187 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	HHAT	Q5VTY9	493 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF691	Q5VV52	312 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6P435	159 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	AHSA2	Q719I0	299 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC6	Q86X45	466 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	DOK4	Q8TEW6	326 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	PEBP4	Q96S96	227 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TMED9	Q9BVK6	235 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IFT46	Q9NQC8	304 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL5A	Q9Y689	179 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		2.54	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CBR3	O75828	277 aa		2.53	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2J2	O76002	312 aa		2.53	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	HLA-DQA1	P01909	254 aa		2.53	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IFNA16	P05015	189 aa		2.53	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TPM3	P06753	285 aa		2.53	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF688	P0C7X2	276 aa		2.53	□□□□□ -2

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