RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 C5orf49A4QMS7 147 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TNFSF13O75888 250 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 LINC00614P0C842 121 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TNFSF10P50591 281 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 SOX8P57073 446 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TPPP2P59282 170 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 CATR1Q13166 79 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 NCKAP5O14513 1909 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 MARCH11A6NNE9 402 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 DLEU1O43261 78 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 MPDU1O75352 247 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 SFTPCP11686 197 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 NPPCP23582 126 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 WDR31Q8NA23 367 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 LILRA1O75019 489 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 WISP2O76076 250 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 CLDN14O95500 239 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 KRASP01116 189 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 CHRNA7P36544 502 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 MPLP40238 635 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 GFRA1P56159 465 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 GNB1P62873 340 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 PLP2Q04941 152 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TFF3Q07654 80 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 DTD1Q8TEA8 209 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ABHD3Q8WU67 409 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TAAR6Q96RI8 345 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TBX15Q96SF7 602 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 A0A0G2JMM0 328 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PPB8 328 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PRS3 328 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ODAMA1E959 279 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 J3QW42 95 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 YPEL1O60688 119 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 WDR1O75083 606 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 HPRT1P00492 218 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 CCNOP22674 350 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 FOLR3P41439 243 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 OR3A1P47881 315 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 CASP6P55212 293 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 SFRP2Q96HF1 295 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ZNF488Q96MN9 340 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 YPEL2Q96QA6 119 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ATG101Q9BSB4 218 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 OR51B6Q9H340 312 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 RAC2P15153 192 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 ERVK11-1P61568 191 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 CLN8Q9UBY8 286 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 TRAPPC6AO75865 159 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 OR2H2O95918 312 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 KITLGP21583 273 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 G0S2P27469 103 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 GDF1P27539 372 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-202ENST00000542324 GCH1P30793 250 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms