RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CHRNA7	P36544	502 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RORC	P51449	518 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	WNT4	P56705	351 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	DEFA1	P59665	94 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	DEFA3	P59666	94 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	PITPNA	Q00169	270 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RSU1	Q15404	277 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MED22	Q15528	200 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	AMBN	Q9NP70	447 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SSR3	Q9UNL2	185 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ING4	Q9UNL4	249 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	GAB2	Q9UQC2	676 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	AIP	O00170	330 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM127	O75204	238 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RGS11	O94810	467 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CD1A	P06126	327 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CSN3	P07498	182 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RAB3A	P20336	220 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR3A3	P47888	321 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	GNMT	Q14749	295 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ECSCR	Q19T08	205 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MPV17L	Q2QL34	196 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CADM3	Q8N126	398 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR4K15	Q8NH41	348 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	IL17D	Q8TAD2	202 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MS4A10	Q96PG2	267 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SOST	Q9BQB4	213 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	METTL9	Q9H1A3	318 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXL15	Q9H469	300 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	GNG12	Q9UBI6	72 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	DHDH	Q9UQ10	334 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM212	A6NML5	194 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	RRH	O14718	337 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	MYL12B	O14950	172 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	SPINT2	O43291	252 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	PROP1	O75360	226 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	SC5D	O75845	299 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	BRI3	O95415	125 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	HLA-DQB1	P01920	261 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	LIMS3	P0CW19	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	LIMS4	P0CW20	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	CT45A6	P0DMU7	189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	CT45A5	P0DMU8	189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	CT45A7	P0DMV0	189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	MYL12A	P19105	171 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	TNFSF8	P32971	234 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	SOX2	P48431	317 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAM1	Q15629	374 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC00596	Q86U02	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	SYS1	Q8N2H4	156 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	LFNG	Q8NES3	379 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	AP3S1	Q92572	193 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM106A	Q96A25	262 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	ORAI1	Q96D31	301 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	GPER1	Q99527	375 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	ALG8	Q9BVK2	526 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	CST11	Q9H112	138 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM4B-208	ENST00000534198	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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