RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531050.5

PTPRK-219, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRK, Length 2,515 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-219ENST00000531050 PGCP20142 388 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 WASP42768 502 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 PPOXP50336 477 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 HERV-K104P63124 156 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 DEFB103AP81534 67 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 ACSM6Q6P461 480 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 BLNKQ8WV28 456 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 NAT6Q93015 286 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 GP6Q9HCN6 339 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TMEM189A5PLL7 270 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 C2orf70A6NJV1 201 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 SLC17A3O00476 420 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 NDUFB4O95168 129 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 SERPINE2P07093 398 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 UBE2G1P62253 170 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 FOXE3Q13461 319 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 OR4C3Q8NH37 302 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 MBD6Q96DN6 1003 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 SPATA25Q9BR10 227 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 CCL26Q9Y258 94 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 OR11H12B2RN74 326 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 BMPR1BO00238 502 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 DEGS1O15121 323 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 HLA-DRB1P01911 266 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 LIPFP07098 398 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 CD1BP29016 333 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 NTSR1P30989 418 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 PSG7Q13046 419 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TMEM25Q86YD3 366 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 OR11H1Q8NG94 326 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 OR11H2Q8NH07 326 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 PERPQ96FX8 193 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 OR4C12Q96R67 309 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 STRADBQ9C0K7 418 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 PTPRSQ13332 1948 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 hDV102S1A0JD36 115 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 SRIP30626 198 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 VEGFBP49765 207 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 MYBPHQ13203 477 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 GABRA6Q16445 453 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 LTC4SQ16873 150 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 GATSQ8NAP1 163 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.356e-7■□□□□ 9.3
PTPRK-219ENST00000531050 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 NUS1Q96E22 293 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 DEFB118Q96PH6 123 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 JKAMPQ9P055 326 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 PSG8Q9UQ74 426 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-219ENST00000531050 GPR75O95800 540 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 SLC35E2P0CK97 266 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF823P16415 610 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 CRYBB3P26998 211 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 OTX2P32243 289 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 PTGDSP41222 190 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 GPR1P46091 355 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 ATP5G3P48201 142 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 TGFBR3Q03167 851 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-219ENST00000531050 RAB30Q15771 203 aa6.58□□□□□ -1.36
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