RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 ELK1P19419 428 aa11.14□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 GDNFP39905 211 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 GLP1RP43220 463 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB7AP51149 207 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 INSL3P51460 131 aa11.14□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 ARL11Q969Q4 196 aa11.14□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.14□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 C12orf77C9JDV5 145 aa11.13□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 CTDSP2O14595 271 aa11.12□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 IGKV1-33P01594 117 aa11.12□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 DTYMKP23919 212 aa11.12□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 UTF1Q5T230 341 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 RFESDQ8TAC1 157 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 KIRREL1Q96J84 757 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 CITED4Q96RK1 184 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM235A6NFC5 223 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 MCFD2Q8NI22 146 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 GALMQ96C23 342 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.11□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 TRDCB7Z8K6 153 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 RGS5O15539 181 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 DIRAS3O95661 229 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 FCGR3AP08637 254 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 GPR12P47775 334 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 TAS2R20P59543 309 aa11.1□□□□□ -0.63
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UBASH3B-202ENST00000525711 FHL3Q13643 280 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 STEAP3Q658P3 488 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 OVCH2Q7RTZ1 564 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 RNF152Q8N8N0 203 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 OR11H1Q8NG94 326 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 OR1L1Q8NH94 360 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 SETD6Q8TBK2 473 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 SSX5O60225 188 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 OR8U8P0C7N1 319 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 VDAC1P21796 283 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 PRSS3P35030 304 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 CBX5P45973 191 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF429Q86V71 674 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-202ENST00000525711 OR2S2Q9NQN1 319 aa11.09□□□□□ -0.63
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