RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 RAB39BQ96DA2 213 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 WFDC1Q9HC57 220 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 A4D1N5 150 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SIRPB1O00241 398 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PDCD6O75340 191 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SCGB1D1O95968 90 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 FAM157CP0CG43 387 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 BCL3P20749 454 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CEACAM3P40198 252 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 RAB9AP51151 201 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1CBP62140 327 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TCF15Q12870 199 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 MORN2Q502X0 79 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR10J4P0C629 311 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB25P24278 435 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 HERV-K104P63124 156 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 MTURNQ8N3F0 131 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 FRZBQ92765 325 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM18Q96B42 140 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 C9JQL5 133 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 DEGS1O15121 323 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CELA3BP08861 270 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF83P51522 516 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PIGPP57054 158 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CYYR1Q96J86 154 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 F8VVB4 439 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 F8VWA3 439 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SYNGR1O43759 233 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TNFSF13O75888 250 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CD8AP01732 235 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IGFBP7Q16270 282 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 Q96M66 194 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 M0R1B8 84 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PRRG2O14669 202 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 GNG7O60262 68 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ARL3P36405 182 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H3AP68431 136 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 HOGA1Q86XE5 327 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PRSS33Q8NF86 280 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR1P1Q8NH06 330 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TMED6Q8WW62 240 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 MOB3AQ96BX8 217 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF292O60281 2723 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 UMAD1C9J7I0 102 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 C3orf80F5H4A9 247 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 MT-CO2P00403 227 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CRYAAP02489 173 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 UCP3P55916 312 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 QRFPP83859 136 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ELOBQ15370 118 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 LTC4SQ16873 150 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.69□□□□□ -1.34
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