RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 APOOQ9BUR5 198 aa6.96□□□□□ -1.29
CLVS1-204ENST00000518858 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLVS1-204ENST00000518858 HDAC8Q9BY41 377 aa6.96□□□□□ -1.29
CLVS1-204ENST00000518858 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CLVS1-204ENST00000518858 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.96□□□□□ -1.29
CLVS1-204ENST00000518858 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 K7ERU9 68 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 HS3ST1O14792 307 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GNG7O60262 68 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SPINK4O60575 86 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PAGE4O60829 102 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GPX1P07203 203 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GNRHRP30968 328 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CDAP32320 146 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NIT1Q86X76 327 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NT5CQ8TCD5 201 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SMIM12Q96EX1 92 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 A0A0G2JRQ6 117 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MPPED1O15442 326 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CER1O95813 267 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 C3orf79P0CE67 100 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CD59P13987 128 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PSMB3P49720 205 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PMP22Q01453 160 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SGCBQ16585 318 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 HLA-BQ31612 363 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MPV17L2Q567V2 206 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 DEFB124Q8NES8 71 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.96□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR6C6A6NF89 314 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TAX1BP3O14907 124 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SLC35E2P0CK97 266 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CD38P28907 300 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RHOGP84095 191 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 BAXQ07812 192 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PIP4P1Q86T03 277 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GNB4Q9HAV0 340 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FRYQ5TBA9 3013 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 DPRXA6NFQ7 191 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 C22orf46C9J442 243 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CORTO00230 105 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SLC17A3O00476 420 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NPIPB7O75200 414 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CTSEP14091 401 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 IER3P46695 156 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM177Q53S58 311 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NEUROG1Q92886 237 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 LYRM4Q9HD34 91 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.95□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 A0A1W2PR77 199 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FCN1O00602 326 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PLPP3O14495 311 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RER1O15258 196 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF253O75346 499 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NAPSAO96009 420 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF883P0CG24 379 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NTF3P20783 257 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OTX2P32243 289 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CLDN18P56856 261 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 HERV-K104P61576 105 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 Q6ZPA2 131 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM234Q8WY98 164 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms