RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 SHISA7A6NL88 538 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 NUPR1O60356 82 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM87AP0C7U9 286 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FCGR2AP12318 317 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 RNF144BQ7Z419 303 aa7.52□□□□□ -1.21
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GPBP1-208ENST00000514387 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 Q8N976 141 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 WNT6Q9Y6F9 365 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.52□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 TSPOP30536 169 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 GABRA2P47869 451 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 OTPQ5XKR4 325 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 DTX1Q86Y01 620 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 PIGTQ969N2 578 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 GALMQ96C23 342 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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GPBP1-208ENST00000514387 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 CXCL10P02778 98 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 CLDN15P56746 228 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 RHOBP62745 196 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 BAGE3Q86Y29 109 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 BAGE2Q86Y30 109 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 OR4F5Q8NH21 305 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 DYRK2Q92630 601 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 OR4F4Q96R69 305 aa7.51□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.51□□□□□ -1.21
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GPBP1-208ENST00000514387 K7EQM0 130 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 SERF1AO75920 110 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 PSG2P11465 335 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 OOSP2Q86WS3 158 aa7.5□□□□□ -1.21
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GPBP1-208ENST00000514387 DEC1Q9P2X7 70 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 M0QXV9 152 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 S1PR2O95136 353 aa7.5□□□□□ -1.21
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GPBP1-208ENST00000514387 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 TAX1BP3O14907 124 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 PDCD6O75340 191 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 F2RP25116 425 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 THBS3P49746 956 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 LINC00310P59036 64 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 PSMF1Q92530 271 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF524Q96C55 264 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 IL36BQ9NZH7 164 aa7.5□□□□□ -1.21
GPBP1-208ENST00000514387 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.5□□□□□ -1.21
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