RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	JPT2	Q9H910	190 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	WFDC1	Q9HC57	220 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	RAB18	Q9NP72	206 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	MEMO1	Q9Y316	297 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	SPEG	Q15772	3267 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331		G3V4G9	280 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331		K7EPK0	472 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331		M0R129	80 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	AGPAT2	O15120	278 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	OR7C2	O60412	319 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	RCBTB2	O95199	551 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	TSPAN13	O95857	204 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	IGSF6	O95976	241 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	MT-CO2	P00403	227 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	LIMS3	P0CW19	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	LIMS4	P0CW20	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	CT45A8	P0DMV1	189 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	CT45A9	P0DMV2	189 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF19	P17023	458 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	IMPA1	P29218	277 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	S100G	P29377	79 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	OPRD1	P41143	372 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	LPAR6	P43657	344 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	RGR	P47804	291 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	NOV	P48745	357 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	RND2	P52198	227 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	BID	P55957	195 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	HIST1H3A	P68431	136 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	HMGCS1	Q01581	520 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	FUT7	Q11130	342 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ST3GAL3	Q11203	375 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	C1orf189	Q5VU69	101 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	NIPAL3	Q6P499	406 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF567	Q8N184	647 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	COX18	Q8N8Q8	333 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	LFNG	Q8NES3	379 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	PPTC7	Q8NI37	304 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	PPCDC	Q96CD2	204 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	VSTM2L	Q96N03	204 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	OR5B12	Q96R08	314 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	OR7D2	Q96RA2	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	IMMP2L	Q96T52	175 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	GINS3	Q9BRX5	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	DOHH	Q9BU89	302 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	RERGL	Q9H628	205 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	ALG9	Q9H6U8	611 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	BET1L	Q9NYM9	111 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GFM2-208	ENST00000513331	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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