RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512107.5

MATR3-238, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-238	ENST00000512107	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	LINC00473	A8K010	186 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107		H3BUX3	64 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	FBP1	P09467	338 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	CSF1	P09603	554 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	GNRHR	P30968	328 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	BTC	P35070	178 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	LY6E	Q16553	131 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	TEX29	Q8N6K0	151 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	RPE	Q96AT9	228 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107		M0R1X1	148 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	RAB29	O14966	203 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	CHST1	O43916	411 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	AMY2A	P04746	511 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	GPR12	P47775	334 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	PPP5C	P53041	499 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	BAMBI	Q13145	260 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107		A6NDX4	124 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	TNFSF12	O43508	249 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	PI3	P19957	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	RAB7A	P51149	207 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	HILS1	P60008	231 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF846	Q147U1	533 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	S100Z	Q8WXG8	99 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	DDB2	Q92466	427 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MATR3-238	ENST00000512107		H0YJW9	148 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	CNTFR	P26992	372 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	TSPAN5	P62079	268 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107		Q8N6K4	173 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	VSIG4	Q9Y279	399 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	TBP	P20226	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	IL3RA	P26951	378 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	CEACAM3	P40198	252 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	CCR6	P51684	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	DYNLT3	P51808	116 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	HERV-K104	P61576	105 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	HNF4G	Q14541	408 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107		Q6ZS46	218 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	AMY1A	P04745	511 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	F2RL1	P55085	397 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	EBI3	Q14213	229 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	MEF2D	Q14814	521 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MATR3-238	ENST00000512107	S1PR3	Q99500	378 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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