RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 DUX3Q96PT4 197 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD60Q9BZ19 345 aa5.81□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 SLC31A2O15432 143 aa5.81□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 SRMP19623 302 aa5.81□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.81□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 AGMATQ9BSE5 352 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.81□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 CD5P06127 495 aa5.8□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM18P0DKX4 95 aa5.8□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 OR4A5Q8NH83 315 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 RNF183Q96D59 192 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 LGALS12Q96DT0 336 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 SLC29A1Q99808 456 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM19Q96E16 107 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 TUBA4BQ9H853 241 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 GNG12Q9UBI6 72 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.79□□□□□ -1.48
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PDE4D-210ENST00000503258 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 OR2AK2Q8NG84 335 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 Q9H521 79 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 TUSC2O75896 110 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 HTR3BO95264 441 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
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