RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498287.5

LRIG1-209, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, human

TSL 4

Gene LRIG1, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRIG1-209	ENST00000498287	DERL3	Q96Q80	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	CA2	P00918	260 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	CPE	P16870	476 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	PSG5	Q15238	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	CD1A	P06126	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	AADAC	P22760	399 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287		Q8N402	240 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	CLCC1	Q96S66	551 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRIG1-209	ENST00000498287	BRI3	O95415	125 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	NAPSA	O96009	420 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ZBTB25	P24278	435 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	FXYD3	Q14802	87 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	APOA2	P02652	100 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	CNIH1	O95406	144 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	TTC23	Q5W5X9	447 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PTX4	Q96A99	478 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	TM2D1	Q9BX74	207 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	IGKV1-16	P04430	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	CEL	P19835	753 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	CEACAM6	P40199	344 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	LGALS7	P47929	136 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	CYYR1	Q96J86	154 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	SLC25A17	O43808	307 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	OR2A4	O95047	310 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ST3GAL4	Q11206	333 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PHYHIP	Q92561	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287		A0A0B4J203	849 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	MYL12B	O14950	172 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	AIRE	O43918	545 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	BPNT1	O95861	308 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	HTR2C	P28335	458 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	WNT4	P56705	351 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LRIG1-209	ENST00000498287	CSN3	P07498	182 aa		13.46	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms