RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A31Q9H0C2 315 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 TUBA4BQ9H853 241 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 RBFOX3A6NFN3 312 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 TNFSF13O75888 250 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 ZNF124Q15973 351 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 Q3ZCU0 254 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 SEM1Q6ZVN7 128 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 LRP11Q86VZ4 500 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 DRAM1Q8N682 238 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 LFNGQ8NES3 379 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 RAB39BQ96DA2 213 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 STARD4Q96DR4 205 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 WIPI2Q9Y4P8 454 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 A0A087X0M5 115 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GX30 115 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 LMO1P25800 156 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 RHEBQ15382 184 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 MOB1BQ7L9L4 216 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 RPRMLQ8N4K4 120 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 HES4Q9HCC6 221 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 APC2O95996 2303 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 C12orf77C9JDV5 145 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 MSMPQ1L6U9 139 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 C5orf30Q96GV9 206 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 DCTN5Q9BTE1 182 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GU03 582 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 LINC00205P59089 165 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 SPSB3Q6PJ21 355 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 FAM180AQ6UWF9 173 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 WDR82Q6UXN9 313 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 MUCL1Q96DR8 90 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 COQ2Q96H96 371 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 TMEM210A6NLX4 147 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 H3BQ15 152 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 ARL16Q0P5N6 197 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 ELOBQ15370 118 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 CLEC12BQ2HXU8 276 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 ACP7Q6ZNF0 438 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 RFESDQ8TAC1 157 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 MRGPRDQ8TDS7 321 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 ABHD14BQ96IU4 210 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 SNX22Q96L94 193 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 CXXC4Q9H2H0 198 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 BTBD17A6NE02 478 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 IFNL4K9M1U5 179 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 PHOX2AO14813 284 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 SOX15O60248 233 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-43DP0DP04 118 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 G0S2P27469 103 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 GLIPR1P48060 266 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 RPL30P62888 115 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 PROCRQ9UNN8 238 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 K7EM74 188 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 RAMP3O60896 148 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 CGAP01215 116 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 HBZP02008 142 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 DDTP30046 118 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 GABRA2P47869 451 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 DLK1P80370 383 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 KCNIP1Q9NZI2 227 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 DEFB108AA8MXU0 73 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 METTL15P1P0C7V9 234 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 MMP9P14780 707 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 IL2RGP31785 369 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 UBE2KP61086 200 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 SPRNQ5BIV9 151 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 BTNL3Q6UXE8 466 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 FRZBQ92765 325 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 OR2D2Q9H210 308 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 ZGRF1Q86YA3 2104 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-213ENST00000492657 AHRRA9YTQ3 701 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 TM4SF5O14894 197 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 IGLV1-44P01699 117 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 SSTR5P35346 364 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 ZNF83P51522 516 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 COL10A1Q03692 680 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 HNF4GQ14541 408 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-213ENST00000492657 ZNF718Q3SXZ3 478 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms