RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 RRHO14718 337 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TXNL1O43396 289 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CA2P00918 260 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CD37P11049 281 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SPNP16150 400 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF616Q08AN1 781 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 PSG5Q15238 335 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 LFNGQ8NES3 379 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 Q9N2K0 584 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SLC17A2O00624 439 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 LDLRAD4O15165 306 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SLC25A17O43808 307 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CA11O75493 328 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 BPNT1O95861 308 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TRBV12-3P01733 135 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GLAP06280 429 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GSTT2P0CG29 244 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GSTT2BP0CG30 244 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ARSBP15848 533 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GNB3P16520 340 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 EDN2P20800 178 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TPBGQ13641 420 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 PLGLAQ15195 96 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 STEAP3Q658P3 488 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM65Q6PI78 240 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OR5T1Q8NG75 326 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 PHYHIPQ92561 330 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 UFD1Q92890 307 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CNBD2Q96M20 576 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GPHA2Q96T91 129 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 DUSP21Q9H596 190 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 RDH8Q9NYR8 311 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GHRLQ9UBU3 117 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 VSIG4Q9Y279 399 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 M0R1X1 148 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OVOL1O14753 267 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 RAB29O14966 203 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 BET1O15155 118 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 HSPA12AO43301 675 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 RGS10O43665 173 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SAP30O75446 220 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV2-23P01705 113 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 PRH1P02810 166 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OR8U9P0C7N5 309 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 UBBP0CG47 229 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CPEP16870 476 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CRHBPP24387 322 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TPPP2P59282 170 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 RAB11BQ15907 218 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 RNLSQ5VYX0 342 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 MGLLQ99685 303 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 GON7Q9BXV9 100 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 C8orf4Q9NR00 106 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 SCN3BQ9NY72 215 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 KIAA1456Q9P272 454 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 U3KQK5 164 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 ERICH4A6NGS2 130 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC3-211ENST00000491581 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms