RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF90Q03938 601 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SLAQ13239 276 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 HLA-BQ31612 363 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MPV17L2Q567V2 206 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ASCL4Q6XD76 172 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TCF23Q7RTU1 214 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF695Q8IW36 515 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GPER1Q99527 375 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CCDC3Q9BQI4 270 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 APOOQ9BUR5 198 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TM2D1Q9BX74 207 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 VSIRQ9H7M9 311 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PEMTQ9UBM1 199 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CD207Q9UJ71 328 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 EML5Q05BV3 1969 aa3.12□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 COL4A5P29400 1685 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SHISA7A6NL88 538 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 H0YJW9 148 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MPPED1O15442 326 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PDE6DO43924 150 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 NUDT3O95989 172 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CA2P00918 260 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TNFP01375 233 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TTRP02766 147 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CYC1P08574 325 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 DRD1P21728 446 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CBLN1P23435 193 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SRD5A2P31213 254 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 WDR82Q6UXN9 313 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 FAM57BQ71RH2 274 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ERASQ7Z444 233 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 UBALD2Q8IYN6 164 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 OR5AS1Q8N127 324 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SUMF1Q8NBK3 374 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 NT5CQ8TCD5 201 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SFRP2Q96HF1 295 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF479Q96JC4 524 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 AP1S3Q96PC3 154 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RAB40CQ96S21 281 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 NRTNQ99748 197 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 STRADBQ9C0K7 418 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GNB4Q9HAV0 340 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ST20Q9HBF5 79 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 FAM206AQ9NX38 181 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 IL36BQ9NZH7 164 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PILRBQ9UKJ0 227 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RNF114Q9Y508 228 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 INSL6Q9Y581 213 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SPACA6W5XKT8 324 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 DOCK3Q8IZD9 2030 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 NUMA1Q14980 2115 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 A0A1W2PP11 408 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RAB29O14966 203 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 AGFG2O95081 481 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GPR75O95800 540 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM50AO95807 157 aa3.11□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 IGKV1D-16P01601 117 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms