RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF134	P52741	427 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R20	P59543	309 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPC4	P59998	168 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	HES1	Q14469	280 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N6K4	173 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC31A2	O15432	143 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	LANCL1	O43813	399 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	TPPP	O94811	219 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ELK1	P19419	428 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZPA2	131 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR12	P47775	334 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	REG1B	P48304	166 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35B1	P78383	322 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMB11	A5LHX3	300 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424		G3V4G9	280 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SSX5	O60225	188 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	MOS	P00540	346 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	FBLN7	Q53RD9	439 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	AP4M1	O00189	453 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SULT1C2	O00338	296 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A5	O76082	557 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	OR3A3	P47888	321 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	PF4V1	P10720	104 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	CD33	P20138	364 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	MC5R	P33032	325 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A5	P33763	92 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R46	P59540	309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	HNF4G	Q14541	408 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	STPG2	Q8N412	459 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N9W7	124 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-216	ENST00000489424	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.64	□□□□□ -0.23

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