RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489333.1

GABRE-210, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 2

Gene GABRE, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-210ENST00000489333 SIGLEC5O15389 551 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CST7O76096 145 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 OPN1MWP04001 364 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 BCL2P10415 239 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PSG2P11465 335 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 GZMHP20718 246 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 KITLGP21583 273 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 OMGP23515 440 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 S100PP25815 95 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IL2RGP31785 369 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 KIR2DS2P43631 304 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 GLIPR1P48060 266 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PAX9P55771 341 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HTD2P86397 168 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 P2RY6Q15077 328 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TESK1Q15569 626 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 OR2T2Q6IF00 324 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 GGACTQ9BVM4 153 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CACNG5Q9UF02 275 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 A0A1B0GWJ7 208 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 SMCO3A2RU48 225 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 AHRRA9YTQ3 701 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CLDN34H7C241 214 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 ITGB1BP1O14713 200 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 SPINT2O43291 252 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CLDN14O95500 239 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 HAND1O96004 215 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 IGHV2-5P01817 119 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CELA3AP09093 270 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 OR13C7P0DN81 318 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 GLI4P10075 376 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 COX5AP20674 150 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 COL8A1P27658 744 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CEACAM6P40199 344 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 PSMB3P49720 205 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CTAG1AP78358 180 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 TNFRSF9Q07011 255 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 ZNF154Q13106 437 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 ICAM4Q14773 271 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 PDCD1Q15116 288 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 LCE2CQ5TA81 110 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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GABRE-210ENST00000489333 SSX8Q7RTT4 187 aa7.27□□□□□ -1.25
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GABRE-210ENST00000489333 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 FGFRL1Q8N441 504 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 DRAM1Q8N682 238 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 ZNF525Q8N782 197 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 ZNF709Q8N972 641 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.27□□□□□ -1.25
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GABRE-210ENST00000489333 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.27□□□□□ -1.25
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GABRE-210ENST00000489333 CHODLQ9H9P2 273 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 PRSS50Q9UI38 385 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 GAB2Q9UQC2 676 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 SVILO95425 2214 aa7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 A0A1W2PPH5 198 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CYB5BO43169 146 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 ZNF205O95201 554 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 VENTXO95231 258 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 TMEM50AO95807 157 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 IGKV3-15P01624 115 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CCL2P13500 99 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 S100A2P29034 98 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 GCH1P30793 250 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 CFHR2P36980 270 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 FHITP49789 147 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 TNFSF10P50591 281 aa7.26□□□□□ -1.25
GABRE-210ENST00000489333 RND2P52198 227 aa7.26□□□□□ -1.25
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