RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 C10orf35Q96D05 121 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 DEPPQ9NTK1 212 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 TRAV34A0A0B4J273 112 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 PINLYPA6NC86 204 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SYNGR3O43761 229 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CBR3O75828 277 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 ZNF32P17041 273 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CRYGSP22914 178 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CLDN15P56746 228 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 FAM27BQ5VT28 67 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 WDYHV1Q96HA8 205 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 NCOR1O75376 2440 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 VAMP5O95183 116 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 ADMP35318 185 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 OR8B8Q15620 311 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 ZNF611Q8N823 705 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CLEC18CQ8NCF0 446 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SGCZQ96LD1 299 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 OR51B6Q9H340 312 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CLDN1O95832 211 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 TDGF1P13385 188 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 RANP62826 216 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 TMEM105Q8N8V8 129 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SLC35E1Q96K37 410 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 TXN2Q99757 166 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 C11orf94C9JXX5 98 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 H0Y980 276 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 TYMSP04818 313 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 MPLP40238 635 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CARD18P57730 90 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 LCN2P80188 198 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 HAPLN4Q86UW8 402 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 ABHD3Q8WU67 409 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 BTF3L4Q96K17 158 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 ZNF716A6NP11 495 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SPINK2P20155 84 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 FAM186AA6NE01 2351 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SERF1AO75920 110 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 C1QTNF9P0C862 333 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CRISP2P16562 243 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 RAC3P60763 192 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 PSG4Q00888 419 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 OR10D3Q8NH80 312 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 TMEM38BQ9NVV0 291 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CBLN1P23435 193 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 FUT6P51993 359 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SOX8P57073 446 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 ACSM6Q6P461 480 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 OR1F12Q8NHA8 337 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 DOCK7Q96N67 2140 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 LNP1A1A4G5 178 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 NDUFB4O95168 129 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 P04436 131 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 MSMO1Q15800 293 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 FFAR4Q5NUL3 377 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 AAED1Q7RTV5 226 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 DERL1Q9BUN8 251 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CYC1P08574 325 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SPINK14Q6IE38 97 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 UBALD1Q8TB05 177 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 OR5G3P0C626 314 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 KITLGP21583 273 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 LEMD1Q68G75 181 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZSR3 168 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZVH6 145 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 TECTBQ96PL2 329 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 HS3ST1O14792 307 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-212ENST00000488380 SRD5A2P31213 254 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms