RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475553.1

USP37-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 37, human

TSL 4

Gene USP37, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP37-208	ENST00000475553	PIGU	Q9H490	435 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ZNF222	Q9UK12	451 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553		A0A1W2PQD3	144 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ISPD	A4D126	451 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ZNF716	A6NP11	495 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553		M0R3G1	203 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ATP6V1G2	O95670	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	SHBG	P04278	402 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	GLA	P06280	429 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CECR9	P0C854	216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ZNF735	P0CB33	412 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ZNF43	P17038	809 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	RAB3B	P20337	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	AQP5	P55064	265 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	HBA1	P69905	142 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	HOXC5	Q00444	222 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	DEFA6	Q01524	100 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	GLO1	Q04760	184 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CASP8	Q14790	479 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MAPK14	Q16539	360 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OR5B3	Q8NH48	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CENPH	Q9H3R5	247 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ACER3	Q9NUN7	267 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CENPBD1	B2RD01	187 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553		B4DSR2	109 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553		L7N2F9	121 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553		M0R233	179 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	PLIN3	O60664	434 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OR2J3	O76001	311 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	VAMP5	O95183	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MPZL1	O95297	269 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	HLA-H	P01893	362 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	C1QC	P02747	245 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	PRPS1L1	P21108	318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	COL8A2	P25067	703 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	LCN1	P31025	176 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	COPZ1	P61923	177 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	GRINA	Q7Z429	371 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MDP1	Q86V88	176 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	IFT20	Q8IY31	132 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	SFXN5	Q8TD22	340 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ROPN1L	Q96C74	230 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	HMG20A	Q9NP66	347 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TG	P01266	2768 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	BET1	O15155	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	KRT34	O76011	436 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	AHSA1	O95433	338 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	RAB36	O95755	333 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	IFNA14	P01570	189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	SERPINA5	P05154	406 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	BCHE	P06276	602 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MSMB	P08118	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TFPT	P0C1Z6	253 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CCL2	P13500	99 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CCNO	P22674	350 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	S100A3	P33764	101 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CRAT	P43155	626 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	DNAJB13	P59910	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CCL8	P80075	99 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	LCN2	P80188	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	FUT5	Q11128	374 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	RGN	Q15493	299 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ZNF141	Q15928	474 aa		3.35	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms