RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	HSPA12A	O43301	675 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TXNL1	O43396	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ORC5	O43913	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR2F2	O95006	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	HBZ	P02008	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	UCHL1	P09936	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	CPE	P16870	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MYCNOS	P40205	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PAX5	Q02548	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	HNF4G	Q14541	408 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	IRF3	Q14653	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	GALM	Q96C23	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953		A0A075B6Q4	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953		A0A1W2PPI3	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MT-ND4	P03905	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	GLA	P06280	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	CD3G	P09693	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	GADD45A	P24522	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	CLDN12	P56749	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TSPAN5	P62079	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SLC35B1	P78383	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PRR20E	P86478	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PRR20C	P86479	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PRR20D	P86480	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PRR20B	P86481	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PRR20A	P86496	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FABP5	Q01469	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TPBG	Q13641	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	HES5	Q5TA89	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RETN	Q9HD89	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953		V9GY05	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	CCL24	O00175	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RAB3B	P20337	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	CNTFR	P26992	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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