RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM90A14PP0C7W9 464 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 RAC1P63000 192 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PAM16Q9Y3D7 125 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF716A6NP11 495 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf94C9JXX5 98 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 YPEL1O60688 119 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP5G3P48201 142 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ZXDAP98168 799 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PCOLCEQ15113 449 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 GUSBP11Q6P575 273 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 MKXQ8IYA7 352 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 YPEL2Q96QA6 119 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 DIRC2Q96SL1 478 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR35Q9HC97 309 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 USF3Q68DE3 2245 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 NGFP01138 241 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 SELEP16581 610 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP1CBP62140 327 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PARD6AQ9NPB6 346 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 VENTXO95231 258 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 KRASP01116 189 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 WNT2P09544 360 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ADMP35318 185 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC01551Q86U37 167 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 RAMP3O60896 148 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 RHBDL1O75783 438 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFB4O95168 129 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 RFPL3SP0C7P2 107 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 COL8A2P25067 703 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 BRS3P32247 399 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 G6PCP35575 357 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 CDKN1AP38936 164 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TFPI2P48307 235 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 RAC3P60763 192 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 FGFRL1Q8N441 504 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 OR1L1Q8NH94 360 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 MSL2Q9HCI7 577 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PQM1 296 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 MLNRO43193 412 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAPPC6AO75865 159 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 GNB1P62873 340 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZWC4 215 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10D3Q8NH80 312 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 SGMS2Q8NHU3 365 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNA1DQ01668 2161 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 SIRPB1O00241 398 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 SRFP11831 508 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PCP4P48539 62 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 THBS3P49746 956 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 GGNQ86UU5 652 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 SPSB4Q96A44 273 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TECTBQ96PL2 329 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 FSCN3Q9NQT6 498 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 DLL3Q9NYJ7 618 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TNFSF13O75888 250 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 CBLN1P23435 193 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 TNFSF10P50591 281 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 SSR4P51571 173 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PCBD1P61457 104 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 CCL7P80098 99 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.7 ms