RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466490.6

SRPRB-201, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SRPRB, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-201ENST00000466490 TDGF1P13385 188 aa11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 KITLGP21583 273 aa11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 TMEM249Q2WGJ8 235 aa11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 LINC00596Q86U02 117 aa11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ADAMTS20P59510 1910 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 A0A1W2PR77 199 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 EGR1P18146 543 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 GPM6AP51674 278 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 COTL1Q14019 142 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 FGFRL1Q8N441 504 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 PSMF1Q92530 271 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 FOXB1Q99853 325 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 A0A0J9YW62 118 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 A0A1W2PR80 420 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 CRYAAP02489 173 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 Q0VG73 95 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF114Q8NC26 417 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 RNF2Q99496 336 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 DERL1Q9BUN8 251 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 SAMD10Q9BYL1 202 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 CD207Q9UJ71 328 aa11.39□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 CTRLP40313 264 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ATP5G3P48201 142 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 RBX1P62877 108 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 TFF3Q07654 80 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 MMDQ15546 238 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 BAGE3Q86Y29 109 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 BAGE2Q86Y30 109 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ORAOV1Q8WV07 137 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 RDH5Q92781 318 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 SRXN1Q9BYN0 137 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ZIC3O60481 467 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 MMP23AO75900 390 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 VWC2Q2TAL6 325 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.38□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 CBLN1P23435 193 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 NTF4P34130 210 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 TIMP3P35625 211 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 RAC1P63000 192 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 OR1L1Q8NH94 360 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 RLN3Q8WXF3 142 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 RAB1CQ92928 201 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 SGCZQ96LD1 299 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 OR6C1Q96RD1 312 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ITGB1BP1O14713 200 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 DNPH1O43598 174 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 TRAPPC6AO75865 159 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 NDUFB8O95169 186 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 LIFP15018 202 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF90Q03938 601 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 LEMD1Q68G75 181 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 PTTG1IPP53801 180 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 UBE2G2P60604 165 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 STPG4Q8N801 248 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 IL36BQ9NZH7 164 aa11.36□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms