RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 OR8U9P0C7N5 309 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 C5orf64Q2M2E5 130 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM71F2Q6NXP2 309 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 ETV3LQ6ZN32 361 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 TSPAN14Q8NG11 270 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 OR8U1Q8NH10 309 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 C5orf30Q96GV9 206 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 PARP11Q9NR21 331 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM235A6NFC5 223 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 G3V318 75 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 J3QRK9 145 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 LSM3P62310 102 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF383Q8NA42 475 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 OR10J5Q8NHC4 309 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2D2Q9H210 308 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 M0R1X1 148 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 FCN1O00602 326 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP6V0E1O15342 81 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 KIR2DS1Q14954 304 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 NPBQ8NG41 125 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 CLCC1Q96S66 551 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 RHBDL2Q9NX52 303 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1456Q9P272 454 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAH3Q8TD57 4116 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A087WXM4 84 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 OR5H14A6NHG9 310 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 NDUFA3O95167 84 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 HLA-DRB1P01911 266 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 VDAC1P21796 283 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 NDPQ00604 133 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 CFHR3Q02985 330 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 TEX38Q6PEX7 206 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 OR5AN1Q8NGI8 311 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC25A38Q96DW6 304 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 YIPF6Q96EC8 236 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 OR51J1Q9H342 316 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXO7Q9Y3I1 522 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 RRHO14718 337 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 SSX5O60225 188 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 TNFAIP8O95379 198 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 SERPINB10P48595 397 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 PLGLAQ15195 96 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 DEFB136Q30KP8 78 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF260Q3ZCT1 412 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 HACD4Q5VWC8 232 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 LIN54Q6MZP7 749 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 WFDC9Q8NEX5 89 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 GINS4Q9BRT9 223 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 TOLLIPQ9H0E2 274 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 SDHAF2Q9NX18 166 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 GAB2Q9UQC2 676 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 AIREO43918 545 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV1-16P04430 117 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 IGF1P05019 195 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 TFAP2AP05549 437 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 MC5RP33032 325 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 COMMD1Q8N668 190 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00482Q8N8I6 264 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFP57Q9NU63 452 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 A3GALT2U3KPV4 340 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 TGP01266 2768 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAV18A0A075B6X5 111 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 FCER2P06734 321 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 PTHLHP12272 177 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 DTYMKP23919 212 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 THBS3P49746 956 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 GNG2P59768 71 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS16P62249 146 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF695Q8IW36 515 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 GHITMQ9H3K2 345 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 TPSG1Q9NRR2 321 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXE3Q13461 319 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 PSG5Q15238 335 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 ECSCRQ19T08 205 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXB2Q5VYV0 432 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 RAX2Q96IS3 184 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 GON7Q9BXV9 100 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 KLK15Q9H2R5 256 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC35D1Q9NTN3 355 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHG4P01861 327 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS19P39019 145 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 CX3CL1P78423 397 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 ARL6IP1Q15041 203 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP5-208ENST00000459627 Q6ZS49 121 aa18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms